Naast research voor het museum doet de Anne Frank Stichting onderzoek naar racistische en extremistische uitingen en ontwikkelingen op het gebied van racisme, antisemitisme en extremisme in Nederland.

Het Instituut voor Nederlandse Geschiedenis maakt het verleden toegankelijk met bronnenpublicaties en naslagwerken.

Gespecialiseerd kennis- en onderzoekscentrum op het gebied van de Nederlandse militaire geschiedenis. Het Instituut is er voor iedereen met belangstelling voor het Nederlandse militaire verleden.

Onderzoeksinstituut op het gebied van Zuid-Oost Azië en het Caribisch gebied. Het instituut heeft een omvangrijke bibliotheek en collectie.

Stichting Centrum '45 is het landelijk instituut voor specialistische diagnostiek en behandeling van psychotraumaklachten ten gevolge van vervolging, oorlog en geweld. Naast de zorg voor patiënten en het geven van onderwijs is wetenschappelijk onderzoek op het gebied van de psychotraumatologie een kerntaak van Stichting Centrum ’45.

Uitgebreid museum over de Holocaust, met een onderzoeksinstituut: ‘The Center for Advanced Holocaust Studies’.

Yad Vashem onderzoekt en documenteert de geschiedenis van de Joden tijdens de Holocaust en behoudt de herinnering aan alle zes millioen slachtoffers. Hiernaast biedt het informatie voor scholen, bibliotheken en musea wereldwijd.